В мире Наруто существуют всевозможные государства различных протяжённости, ландшафтов, культур и военной мощи. Ниже представлены основные страны, которым уделялось наибольшее внимание в манге.

Пять великих стран синоби
Страна Ветра
Страна Ветра (яп. 風の国 Казэ но Куни ?) знаменита своими пустынями и сухими горными цепями. Взаимоотношения Стран Ветра и Огня насчитывает множество перипетий — несколько войн между двумя странами всегда заканчивались мирным договором.

Суна (яп. 砂隠れの里 Сунагакурэ но Сато, Деревня, Скрытая в Песках ?) — одна из пяти великих деревень ниндзя, чьим лидером является Кадзэкагэ. Из-за частых войн своей страны, Суна значительно потеряла в боеспособности, из-за чего Четвёртый Кадзэкагэ запечатал Однохвостого зверя Сюкаку в тело своего сына, Гаары, таким образом надеясь, что тот вырастит мощным оружием для селения. Впоследствии Четвёртый Кадзэкагэ был убит Оротимару, и воспользовавшись этим, злодей настроил Деревню Песка к нападению на Коноху вместе со своими приспешниками из Селения Звука. Однако вскоре заговор был раскрыт и лидеры Суны и Конохи подписали мирный договор.
Суне очень не везло с руководителями: Третий Кадзэкагэ исчез при таинственных обстоятельствах (впоследствии оказалось, что его убил Сасори), Четвёртый Кадзэкагэ был убит Оротимару, а Пятый (Гаара) похищен организацией Акацуки, однако впоследствии спасён.

Страна Воды
Страна Воды (яп. 水の国 Мидзу но Куни ?) состоит из множества островов, на каждом из которых сложились свои традиции. Климат в стране прохладный, с частыми туманами. Самые большие угрозы для страны всегда находились внутри неё: постоянные войны и конфликты вынудили многих горожан и синоби взбунтоваться против правительства и устроить гражданскую войну. Мирные граждане считали, что причиной нескончаемых войн служат могущественные кланы, наделенные генетическими способностями. По этой причине почти все кланы были истреблены.

Кири (яп. 霧隠れの里 Киригакурэ но Сато, Деревня, Скрытая в Тумане ?) — одна из пяти великих деревень ниндзя, чьим лидером является Мидзукагэ. Известна также как родина Семи синоби-мечников Тумана (яп. 霧の忍刀七人衆 кири но нинто нананин сю ?), организации ниндзя, использующих в бою большие мечи. Судя по словам Кисамэ Хосигаки, Мадара Утиха некогда возглавлял Кири в качестве Мидзукагэ.
Селение Тумана в своё время получило известно благодаря ужасным методам обучения искусству ниндзя — студенты, желающие стать синоби, встречались в смертельном поединке лицом к лицу. Из-за этого во время руководства Ягурой, Четвёртым Мидзукагэ, селение получило прозвище Деревня Кровавого Тумана (яп. 血霧の里 Тигири но сато ?). Подобная практика продолжалась вплоть до инцидента, когда Дзабудза Момоти уничтожил весь выпускной курс.
Дзинтюрики в этой деревне являлись Ягура (по неизвестной причине Трёххвостый был извлечён из него до пришествия Акацуки) и Утаката (Шестихвостого, согласно филлеру, заполучил Пэйн)

Страна Земли

Страна Земли (яп. 土の国 Цути но Куни ?) — одна из крупнейших стран в мире Наруто, расположенная к северо-западу от Страны Огня. Ландшафт в основном представлен пустынными или же скалистыми районами. Границы страны проходят вдоль скалистых хребтов, усложняя взаимосвязи с другими странами, но в то же время создавая серьёзную преграду для врагов.
Ива (яп. 岩隠れの里 Ивагакурэ но Сато, Деревня, Скрытая в Скалах ?) — одна из пяти великих деревень ниндзя, чьим лидером является Цутикагэ. Деревня окружена горными хребтами, обеспечивающими защиту, с многочисленными водопадами, и состоит из большого числа башен, соединённых между собой мостами.
В своё время Иве принадлежали дзинтюрики двух бидзю — Четырёххвостого и Пятихвостого, которые впоследствии были захвачены Акацуки, не в последнюю очередь благодаря уроженцу этой деревни — Дэйдаре.

Страна Молнии

Страна Молнии (яп. 雷の国 Каминари но Куни ?) — одна из крупнейших земель в мире Наруто, располагающаяся на полуострове к северо-востоку от Страны Огня. В центре страны расположены массивные горные хребты, частые грозы в которых и дали название этому государству.
Кумо (яп. 雲隠れの里 Кумогакурэ но Сато, Деревня, Скрытая в Облаках ?) — одна из пяти великих деревень ниндзя, чьим лидером является Райкагэ. Селение находится на высокой горе и в прямом смысле спрятано в облаках. Изначально деревня владела двумя бидзю — Двуххвостым, чью дзинтюрики Югито Нии похитили Акацуки, и Восьмихвостым, дзинтюрики которого, брата Четвёртого Райкагэ, Киллер Би, неудачно пытались схватить команда «Така», а впоследствии Кисамэ Хосигаки.
Организация уровней ниндзя в Кумо отличается от принятого в Конохе (Кагэ — дзёнин — тюнин — гэнин): дополнительно введено звание Глава ниндзя (яп. 火の国 Синобигасира ?), определяемое как следующее в иерархии после Райкагэ.

Страна Огня

Страна Огня (яп. 霧隠れの里 Хи но Куни ?) была первым государством, организовавшим своё Селение ниндзя.
Деревня, скрытая в листве (яп. 木ノ葉隠れの里 Конохагакурэ но Сато, Коноха?) — одна из пяти великих деревень ниндзя, чьим лидером является Хокагэ. На окружающих селение горах высечены портреты пяти правителей Конохи.

Коноха в начале аниме
Когда-то давно Хасирама и Мадара, лидеры двух сильнейших воюющих кланов Сэндзю и Утиха соответственно, подписали мирный договор, положив тем самым начало становлению новой деревни ниндзя; позднее подобные начали появляться и в других странах. Вскоре Хасирама Сэндзю был избран Хокагэ, однако не желавший мириться с таким положением дел Мадара Утиха бросил ему вызов, но проиграл, после чего долгое время считался погибшим. В память о битве двух основателей Конохи в Долине Завершения, на границе Страны Огня и Страны Звука, был установлен величественный монумент, изображающий фигуры двух великих ниндзя.

Другие объекты
Гора Мёбоку (яп. 妙木山 Мё:бокузан?) - место обитания жаб, где в своё время тренировались Дзирайя и Наруто.

Селение Скрытого Водопада (Таки (яп. 滝隠れの里 Такигакурэ но Сато?)) — деревня синоби Страны Водопада. Ландшафт этого государства очень схож с ландшафтом страны Огня, её большими деревьями и утёсами. Синоби Водопада участвуют в публичном экзамене тюнинов.

Селение Скрытого Дождя (Амэ (яп. 雨隠れの里 Амэгакурэ но Сато?)) в силу своего географического положения стало полей битвы между ниндзя различных сильных государств. После установления мира руководство Амэ приняло строгую политику конфиденциальности, при которой каждый приезжающий должен был сообщать о себе все данные и находиться под наблюдением практически 24 часа в сутки. Во время гражданской войны лидер Амэ — Хандзо Саламандра был убит Пэйном, после чего тот вместе с Конан захватил власть в деревне.

На территорию Селения Скрытой Звезды (яп. 星隠れの里 Хосигакурэ но Сато?), находящееся в Стране медведей (яп. 熊の国 Кума но Куни ?) около двухсот столетий назад упал заряженный чакрой метеорит, впоследствии прозванный упавшей звездой. Синоби скрытого селения научились использовать его силу. Границы страны обозначена глубоким обрывом, дно которого заволочено ядовитыми газами. Пропасть и ядовитый газ не даёт чужеземцам попасть в страну и похитить метеорит.

В Селении Скрытой Травы (Куса (яп. 草隠れの里 Кусагакурэ но Сато?)) находился мост Каннаби (яп. 神無毘橋 Каннаби-кё ?), уничтожение которого было поручено Команде Минато Намикадзэ — Какаси Хатакэ, Обито Утиха и Рин. Также там находился мост Тэнти (яп. 天地橋 Тэнти-кё ?), на котором Команда № 7 ждала шпиона Сасори, которым оказался Кабуто Якуси.

Страна Волн (яп. 波の国 Нами но Куни?) представляет собой маленький остров, который раньше находился под тираническим руководством судоходного барона Гато. После свержения власти Гато Дзабудзой Момоти и Командой № 7 мост, так необходимый стране, был достроен и назван в честь заглавного героя аниме — «Наруто».

Страна Звука (яп. 音の国 Ото но Куни?) — относительно молодое государство, ранее существовавшее под названием Страна Рисовых Полей (яп. 田の国 Та но Куни?), которое получило название благодаря своей лесистой местности и рисовым полям. В прошлом страна враждовала с соседними землями и одерживала верх, благодаря уникальным способностям проживающих в ней кланов. В стране расположено Ото (яп. 音隠れの里 Отогакурэ но Сато, Селение Скрытого Звука ?), которое использовал Оротимару в качестве своего убежища. На границе со Страной Огня находится знаменитая Долина Завершения, где произошла легендарная битва между Хасирамой Сэндзю и Мадарой Утихой.

Страна Рек (яп. 川の国 Кава но Куни?) лежит между двумя более могущественными странами — Огня и Ветра. Ландшафт государства разнообразен: там есть горы, леса и реки.